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Xy Pubmed Pdf Downloader

Download PDFs from PubMed Central (PMC) and Europe PMC.

Rating: 4.8 (350 reviews)
Downloads: 6,213 downloads
Version: 1.0.0

Overview

Download PDFs from PubMed Central (PMC) and Europe PMC.

Complete Documentation

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XY PubMed PDF Downloader

下载 PubMed Central (PMC) 和 Europe PMC 开放获取论文的 PDF 文件。

功能

支持多种输入格式：PMC ID、PubMed URL、DOI
自动从 URL 中提取 PMC ID
DOI 自动转换为 PMC ID
批量下载支持
自动回退到 Europe PMC

使用方法

单文件下载

bash

python3 scripts/download_pmc_pdf.py <identifier>

支持的 identifier 格式：

PMC ID: PMC12345678 或 12345678
PubMed URL: https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12345678/
DOI: 10.3389/fcvm.2024.1368022

批量下载

创建文本文件 pmc_list.txt，每行一个 ID：

text

PMC12345678
PMC87654321
10.3389/fcvm.2024.1368022
https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC56789012/

运行：

bash

python3 scripts/download_pmc_pdf.py --batch pmc_list.txt

选项

-o, --output : 指定输出目录 (默认: ./downloads)
-f, --filename : 自定义文件名
--batch : 从文件批量下载

示例

bash

# 下载单个 PDF
python3 scripts/download_pmc_pdf.py PMC12867338

# 指定输出目录
python3 scripts/download_pmc_pdf.py PMC12867338 -o ./papers

# 自定义文件名
python3 scripts/download_pmc_pdf.py PMC12867338 -f coronary_prediction.pdf

# 批量下载
python3 scripts/download_pmc_pdf.py --batch id_list.txt -o ./batch_downloads

注意事项

仅支持开放获取 (Open Access) 的文章
如果 PMC 下载失败，会自动尝试 Europe PMC
批量下载时默认有 1 秒延迟，避免对服务器造成压力
需要 requests 库：pip install requests

输出

下载的 PDF 文件保存在指定目录，默认命名格式：

PMC{ID}.pdf (如 PMC12867338.pdf)

错误处理

404: 文章不存在或不是开放获取
DOI 转换失败: 该 DOI 没有对应的 PMC 记录
其他网络错误会显示详细错误信息

Installation

Terminal bash


openclaw install xy-pubmed-pdf-downloader

Copied!

💻Code Examples

python3 scripts/download_pmc_pdf.py <identifier>

python3-scriptsdownloadpmcpdfpy-identifier.txt

支持的 identifier 格式：
- PMC ID: `PMC12345678` 或 `12345678`
- PubMed URL: `https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12345678/`
- DOI: `10.3389/fcvm.2024.1368022`

### 批量下载

创建文本文件 `pmc_list.txt`，每行一个 ID：

python3 scripts/download_pmc_pdf.py --batch pmc_list.txt

python3-scriptsdownloadpmcpdfpy---batch-pmclisttxt.txt

### 选项

- `-o, --output <dir>`: 指定输出目录 (默认: `./downloads`)
- `-f, --filename <name>`: 自定义文件名
- `--batch <file>`: 从文件批量下载

## 示例

example.txt

PMC12345678
PMC87654321
10.3389/fcvm.2024.1368022
https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC56789012/

example.sh

# 下载单个 PDF
python3 scripts/download_pmc_pdf.py PMC12867338

# 指定输出目录
python3 scripts/download_pmc_pdf.py PMC12867338 -o ./papers

# 自定义文件名
python3 scripts/download_pmc_pdf.py PMC12867338 -f coronary_prediction.pdf

# 批量下载
python3 scripts/download_pmc_pdf.py --batch id_list.txt -o ./batch_downloads